Запліднення відбувається у верхньому відділі яйцеводи. Виділення секреторних залоз середньої частини яйцеводу утворюють навколо яйцеклітини (жовтка) білкову оболонку, слабо розвинену у змій і ящірок, І потужну – у черепах та крокодилів (рис.
Ящірки розмножуються, відкладаючи яйця в ґрунт. Через 50–60 днів із яєць з'являються новонароджені ящірки, готові до самостійного життя. Винятком є ящірка живородна (Lacerta vivipara), поширена на півночі і зустрічається навіть у тундрі за Полярним колом. Вона народжує живих дитинчат, числом до 12.
Ящірки можуть бути яйцекладучими, яйцеживородящими (коли яйця залишаються в тілі самки до моменту народження), живородні (з плацентарним типом або циркуляторним зв'язком) та розмножуватися партеногенез.