З клітин, що розташовані на межах між енто- та ектодермою. Саме там розвивається середній листок, що має назву зародковий або мезодерма. Також з мезодерми утворюється кістковий скелет і хрящовий, всі м'язи, судинна, сечова та статева системи.
утворюється телобластичним способом – з великих клітин – телобластів, що лежать між ектодермою і ентодермою в задньому кінці зародка і потрапляють у процесі гаструляції в первинну порожнину тіла, де вони розмножуються і перетворюються на дві мезодермальні смужки.
Розташовується між ектодермою та ентодермою. У різних груп тварин утворюється у різний спосіб.
Тіло Плоських черв'яків формується з трьох шарів клітин: ектодерми, ентодерми та мезодерми (Тобто вони тришарові тварини). У них вперше з'являється третій шар клітин. мезодерма. Мезодерма — середній шар клітин, який залягає між ектодермою та ентодермою.