За участю ендоплазматичного ретикулуму відбувається трансляція та транспорт білків, синтез та транспорт ліпідів та стероїдів. Для ЕПР характерним є також накопичення продуктів синтезу. Ендоплазматичний ретикулум бере участь у тому числі у створенні нової ядерної оболонки (наприклад після мітозу).
ЕПС — ендоплазматична мережа — одномембранна органела всіх еукаріотів. Вона складається з численних канальців та порожнин, які пронизують цитоплазму клітини. Головна функція ЕПС – Транспорт великих молекул органічних речовин, які часто синтезуються на поверхні самої мережі.
Основний функцією гладкої ендоплазматичної мережі є синтез ліпідів (жирів). Наприклад, ЕПС епітелію кишечника синтезує їх із жирних кислот та гліцеролу, що всмоктуються з кишечника. Потім ліпіди потрапляють у комплекс Гольджі.